Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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