Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXO1Q12778 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms