Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TWF1-211ENST00000552521 3012 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1E-203ENST00000360108 6970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 BLACAT1-201ENST00000626538 2994 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 OR10H1-202ENST00000641419 4376 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CECR3-201ENST00000428828 1915 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PDGFD-202ENST00000393158 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC026469.1-201ENST00000621095 3306 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DPP6-201ENST00000332007 3768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LILRA1-202ENST00000453777 2313 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PKD1L2-205ENST00000527937 4165 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CDH5-201ENST00000341529 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CNKSR2-201ENST00000279451 4478 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC4A11-201ENST00000380056 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MICALCL-201ENST00000256186 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAMTSL3-201ENST00000286744 7336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CSHL1-202ENST00000309894 669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GH2-201ENST00000332800 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 KRTAP12-3-201ENST00000397907 410 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AL031777.1-201ENST00000405418 499 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB1C-201ENST00000409159 606 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ELOB-203ENST00000409906 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MT1P3-201ENST00000421424 177 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC245452.4-201ENST00000423821 375 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 COX7A1-202ENST00000437291 407 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC083822.1-201ENST00000438001 201 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 Z69666.1-201ENST00000445733 801 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AL590648.3-201ENST00000446962 473 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AOAH-IT1-201ENST00000449672 573 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PRDX2P1-201ENST00000450181 589 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.6 ms