Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR7

KRTAP3-2, Keratin-associated protein 3-2, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-2Q9BYR7 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 LINC01940-201ENST00000455228 3489 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SLC22A8-201ENST00000311438 1716 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ATL1-202ENST00000441560 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SMG1P3-205ENST00000522480 4262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 LINC01104-202ENST00000452354 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 NFRKB-201ENST00000446488 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC097382.2-201ENST00000500031 4300 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC060780.1-203ENST00000634503 2406 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC132154.1-201ENST00000623248 2134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 VASH2-206ENST00000366968 4224 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SAMD7-202ENST00000428432 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ADGRG1-201ENST00000388813 3925 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RGS6-219ENST00000622468 5453 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 TMEM161B-201ENST00000296595 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF860-201ENST00000360311 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CD300A-203ENST00000361933 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PLA2G6-204ENST00000417303 501 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CHCHD2P4-201ENST00000418701 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PMP22-204ENST00000426385 571 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AL159166.1-201ENST00000437430 329 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CHCHD4P4-201ENST00000437690 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC093162.2-201ENST00000501107 704 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC009901.2-201ENST00000521595 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC084251.1-201ENST00000521867 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC060764.1-201ENST00000603811 454 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AL627230.8-201ENST00000613335 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SH3TC2-215ENST00000515425 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 TMEM254-205ENST00000372281 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ITGA6-207ENST00000458358 3261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SPOCD1-214ENST00000533231 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 DLG3-210ENST00000542398 4529 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 FER1L5-205ENST00000623246 6513 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 ANXA7-202ENST00000372921 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 AC037441.1-202ENST00000511897 3879 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 LINC01964-201ENST00000567718 3137 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP3-2Q9BYR7 DUSP6-201ENST00000279488 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.5 ms