Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SALL4Q9UJQ4 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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