RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRT-209ENST00000612229 MYT1Q01538 1121 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRT-209ENST00000612229 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRT-209ENST00000612229 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PTPRT-209ENST00000612229 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.88□□□□□ -0.67
PTPRT-209ENST00000612229 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
PTPRT-209ENST00000612229 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PTPRT-209ENST00000612229 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PTPRT-209ENST00000612229 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.73□□□□□ -0.69
PTPRT-209ENST00000612229 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRT-209ENST00000612229 APLP2Q06481 763 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRT-209ENST00000612229 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PTPRT-209ENST00000612229 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-209ENST00000612229 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRT-209ENST00000612229 NEFLP07196 543 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRT-209ENST00000612229 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRT-209ENST00000612229 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRT-209ENST00000612229 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM41Q8WV44 630 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRT-209ENST00000612229 HRCP23327 699 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRT-209ENST00000612229 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-209ENST00000612229 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-209ENST00000612229 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-209ENST00000612229 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-209ENST00000612229 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-209ENST00000612229 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRT-209ENST00000612229 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRT-209ENST00000612229 NEFMP07197 916 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRT-209ENST00000612229 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRT-209ENST00000612229 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRT-209ENST00000612229 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRT-209ENST00000612229 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRT-209ENST00000612229 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRT-209ENST00000612229 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-209ENST00000612229 ITGAEP38570 1179 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-209ENST00000612229 ANP32CO43423 234 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-209ENST00000612229 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-209ENST00000612229 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-209ENST00000612229 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-209ENST00000612229 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-209ENST00000612229 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-209ENST00000612229 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-209ENST00000612229 BCANQ96GW7 911 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-209ENST00000612229 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRT-209ENST00000612229 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRT-209ENST00000612229 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-209ENST00000612229 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-209ENST00000612229 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-209ENST00000612229 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRT-209ENST00000612229 NEUROD1Q13562 356 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-209ENST00000612229 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM52Q96A61 297 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRT-209ENST00000612229 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRT-209ENST00000612229 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRT-209ENST00000612229 FKBP8Q14318 412 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 NBR1Q14596 966 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRT-209ENST00000612229 SLC24A1O60721 1099 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 BECN1Q14457 450 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 NRDCO43847 1150 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 TONSLQ96HA7 1378 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 USP35Q9P2H5 1018 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRT-209ENST00000612229 BCL11AQ9H165 835 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRT-209ENST00000612229 CASC1Q6TDU7 716 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRT-209ENST00000612229 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRT-209ENST00000612229 TMC1Q8TDI8 760 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRT-209ENST00000612229 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 ARXQ96QS3 562 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP44Q96MT7 982 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 PTMSP20962 102 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 MRS2Q9HD23 443 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRT-209ENST00000612229 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms