Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF529-201ENST00000334116 5238 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NT5E-203ENST00000369651 3918 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10H1-202ENST00000641419 4376 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AGAP11-201ENST00000433214 3078 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf57-202ENST00000393047 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MCOLN3-203ENST00000370589 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 XPNPEP1-203ENST00000369683 2344 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TAS1R1-202ENST00000351136 1871 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 INSC-202ENST00000379556 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF550-205ENST00000457177 3376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL3-202ENST00000383094 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DCLK2-202ENST00000302176 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FP565260.7-201ENST00000623998 3634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 UST-201ENST00000367463 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms