Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDGFDQ9GZP0 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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