Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U3KQE9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U3KQE9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U3KQE9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U3KQE9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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