Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C3Q9Y5Q9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms