Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9Y3F1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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