Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DTX4Q9Y2E6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms