Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF5Q9Y2D1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF5Q9Y2D1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms