Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2AQ9ULE3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2AQ9ULE3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms