Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRPF3Q9ULD4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms