Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms