Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GGA1Q9UJY5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms