Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIMS3Q9UJD0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms