Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RABGEF1Q9UJ41 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1Q9UJ41 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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