Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CTNNA3Q9UI47 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms