Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DNAI1Q9UI46 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAI1Q9UI46 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms