Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCHIP1Q9P0W5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms