Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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SH3BP4Q9P0V3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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SH3BP4Q9P0V3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP4Q9P0V3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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