Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCMF1Q9P0J7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms