Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EHD2Q9NZN4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EHD2Q9NZN4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms