Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLCO1C1Q9NYB5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO1C1Q9NYB5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms