Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms