Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms