Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASF1BQ9NVP2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms