Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM106BQ9NUM4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms