Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC6A13Q9NSD5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A13Q9NSD5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms