Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMPRSS4Q9NRS4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMPRSS4Q9NRS4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms