Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTPS2Q9NRF8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTPS2Q9NRF8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms