Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BATF3Q9NR55 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BATF3Q9NR55 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms