Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C8orf4Q9NR00 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms