Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB18Q9NP72 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms