Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARFGAP3Q9NP61 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms