Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE7BQ9NP56 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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