Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPR35Q9HC97 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPR35Q9HC97 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms