Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCAS3Q9H6U6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCAS3Q9H6U6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms