Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms