Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NBPF3Q9H094 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms