Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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