Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCL11BQ9C0K0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL11BQ9C0K0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms