Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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