Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GSDMCQ9BYG8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms