Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RSPO3Q9BXY4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RSPO3Q9BXY4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms