Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYCP2Q9BX26 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP2Q9BX26 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms