Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR3CQ9BUI4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms