Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POP1Q99575 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POP1Q99575 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP1Q99575 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POP1Q99575 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP1Q99575 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP1Q99575 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POP1Q99575 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POP1Q99575 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms